أواخر التسعينيات
تسلم بوبي روبسون تدريب النادي لموسم 96-97، فقام بضم رونالدو، الذي كان يلعب مع نادي أيندنهوفن الهولندي. وقام روبسون أيضا بجلب خوسيه مورينو، والذي أصبح مدرب نادي تشيلسي ونادي بورتو فيما بعد، لمساعدته في التدريب كما كان أيضا يترجم لروبسون في مؤتمراته الإعلامية. وبالرغم من أن روبسون استطاع أن يحقق لبرشلونة ثلاثة ألقاب، من ضمنها كأس أبطال الكؤوس وكأس الملك الإسباني, إلا أن أسلوبه الدفاعي لم يرق لمشجعي برشلونة.
كان النادي قد وقع عقدا، قبل نهاية الموسم الأول لروبسون، مع الهولندي لويس فان غال. وعلى الرغم من رحيل رونالدو إلى إنتر ميلان الإيطالي فقد انضم ريفالدو إلى برشلونة واستطاع الفريق أن يفوز بلقب الدوري الإسباني مرتين إلا إن الفريق فشل في الفوز بدوري أبطال أوروبا. ومرة أخرى، فقد أدى النقد الحاد من الجمهور بعد ثلاث مواسم في عام 2000 م إلى استقالة فان غال.
سنين الضياع والاضطراب
في عام 2000 تم انتخاب خوان جاسبارت خلفا لخوسيه لويس نونيز. أوضاع النادي كانت سيئة جدا وخاصة بعد انتقال النجم البرتغالي لويس فيجو إلى ريال مدريد الغريم التقليدي للبارسا في اليوم التالي للانتخابات. بالرغم من إخفاق الإدارة الجديدة السريع فإنها زادت الطين بلة بسياساتها غير الحكيمة. قادت مصروفات خوان جاسبارت على النادي النادي إلى مشاكل مادية ضخمة. تم جلب العديد من المدربين ومع كل مدرب مجموعة من اللاعبين فتجمع للنادي لاعبين موهوبين مميزين خلال فترة 3 سنوات القليل منهم أتيحت له الفرصة للعب مع الفريق وبقي معه. غياب الفريق عن أي لقب محلي أو أوروبي والأداء السيء للاعبي الفريق وارتفاع ديون النادي لتصل لحوالي 150 مليون يورو أدت كلها إلى ضغوط اجتماعية غير محتملة على إدارة النادي الأمر الذي أجبرها على الاستقالة.
عودة الفريق
قامت انتخابات في النادي فاز على إثرها السيد خوان لابورتا الذي بقدومه جلب النجم البرازيلي رونالدينو ومدرب المنتخب الهولندي -سابقا- فرانك رايكارد وأدى ذلك لتحسين أداء النادي بشكل ملحوظ. وضعت خطط اقتصادية للنادي وتم بيع أغلب لاعبيه. في موسم 2003-2004 أنهى الفريق الموسم في المركز الثاني بعد أن قضى نصف مدة الموسم في قعر ترتيب الدوري العام. في الموسم التالي تصدر البارسا الدوري من بداياته وناله باستحقاق ليرفع النادي عدد مرات حصوله عليه لسبع عشرة مرة. و حصل الفريق بعد ذلك على الدوري الإسباني مرة أخرى في موسم 2005-2006 للمرة الثامنة عشرة في تاريخه بقيادة المدرب فرانك ريكارد.
أجمل هدف في تاريخ النادي
نظمت صحيفة ديبورتيفو ال موندو الاسبانية الشهيرة استفتاء شارك فيه 200 الف مشجع للنادي الكاتالوني لاختيار اجمل هدف في تاريخ النادي العريق وقد حل في المرتبة الأولى هدف النجم البرازيلي روماريو في مرمى ريال مدريد موسم 93-94 وحل ثانيا هدف النجم الارجنتيني مارادونا في مرمى ريال مدريد موسم 83 وحل ثالثا هدف النجم الارجنتيني ليونيل ميسي في مرمى خيتافي في كاس اسبانيا موسم 2006.
تشكيلة الفريق
1- فكتور فالدز حارس مرمى
4- رافاييل ماركيز مدافع
5- كارلوس بويول مدافع
6- تشافي هيرنانديز لاعب وسط
7- إيدور غوديونسون مهاجم
8- أندريس أنييستا لاعب وسط
9- صامويل إيتو مهاجم
10- رونالدينيو مهاجم
11- جيانلوكا زامبروتا مدافع
12- غابرييل ميليتو مدافع
13- خوسيه بينتو حارس مرمى
14- تيري هنري مهاجم
15- إدملسون مدافع
16- سيلفينيو مدافع
24- يايا توريهلاعب وسط
18- سانتياغو أزكويرو مهاجم
19- ليونيل ميسي مهاجم
20- ديكو لاعب وسط
21- ليليان تورام مدافع
22- ابيدال مدافع
23- أوليغر مدافع
17- جيوفاني دوس سانتوس مهاجم
24- بويان كركيتش مهاجم
25- ألبرت خوركيرا حارس مرمى